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小白最想擁有的神器,點(diǎn)點(diǎn)鼠標(biāo)一分鐘就能做炫酷的熱圖!

時(shí)間:2022-03-10 來(lái)源: 瀏覽:

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Heatmap (熱圖)最大優(yōu)點(diǎn)就是信息量大卻一目了然。 你會(huì)驚奇地發(fā)現(xiàn),本來(lái)看似雜亂無(wú)章高高低低變化的數(shù)據(jù)做成熱圖后竟然一下子就簡(jiǎn)單了。 文章里如果放個(gè)熱圖,頓時(shí)逼格確實(shí)提升了不少!

目前繪制熱圖的工具很多,像MATLAB、MeV (Multiple ExperimentViewer)、GraphPad Prism、R 語(yǔ)言等等。 但是對(duì)于初入科研大門的小伙伴,我們一般都會(huì)推薦簡(jiǎn)單易上手的工具,強(qiáng)烈安利! 這里有兩款超級(jí)簡(jiǎn)單的熱圖繪制軟件。

一、Heatmap Illustrator

網(wǎng)址: http://hemi.biocuckoo.org/down.php

安裝包可以在官網(wǎng)中直接下載。

①下載完成后,打開(kāi)軟件。

②點(diǎn)擊 File-Load或LOAD將原始數(shù)據(jù) txt 或 Excel 版本導(dǎo)入。

③選擇數(shù)據(jù)文件。

④有多個(gè)Sheet的表格一次只能導(dǎo)入一個(gè)sheet,選擇要導(dǎo)入的sheet。

⑤選擇Auto select以及y-axis title、x-axis title(選擇y-axis title、x-axis title坐標(biāo)軸會(huì)有文字顯示),再選擇finish。

⑥如果對(duì)于熱圖的顏色不滿意,可以點(diǎn)擊set更換顏色。

⑦設(shè)置完成后,點(diǎn)擊“REFRESH”更新熱圖。

⑧對(duì)熱圖展示形式不滿意,還可以點(diǎn)擊DEMO,選擇喜歡的色系和展現(xiàn)形式。

注意:選擇合適的熱圖展示形式后,需要在導(dǎo)入一次數(shù)據(jù),目前Heatmap Illustrator有以下5種展現(xiàn)形式。

⑨導(dǎo)出熱圖。

選擇choose保存格式,可以保存png、jpg和tiff三種格式。

二、Matrix2png

網(wǎng)址: http://www.chibi.ubc.ca/matrix2png/bin/matrix2png.cgi

Matrix2png是一個(gè)簡(jiǎn)單卻實(shí)力強(qiáng)大的矩陣數(shù)據(jù)可視化工具,用于將txt格式的文件轉(zhuǎn)化為png格式的圖片,其特點(diǎn)包括:

1)僅支持PNG輸出格式,需要的輸入文件只能是制表符分隔的txt文件。

2)支持本地繪圖、在線繪圖及l(fā)inux命令行繪圖多種方式。

3)可以人為界定繪圖的數(shù)值范圍。

4)可以方便的從調(diào)色板和流行色圖(color maps)中選擇設(shè)置的顏色。

5)自動(dòng)生成scale bars、row labels和column labels。

6)支持有缺失值以及離散型數(shù)據(jù)的矩陣。

①點(diǎn)擊“選擇文件”導(dǎo)入數(shù)據(jù)文件。

②此工具需要先調(diào)整參數(shù),在進(jìn)行繪制。

對(duì)圖片進(jìn)行基本設(shè)置:包括圖片大小、矩陣是否標(biāo)準(zhǔn)化、顯示的數(shù)值范圍、數(shù)值切割范圍以及是否用圓形代替方形。

設(shè)置顏色:修改最普遍的部分,包括背景色、缺失值顏色以及熱圖主體顏色(有三種方式進(jìn)行選擇)。

選擇添加小工具,包括是否畫(huà)顏色標(biāo)尺、行名稱及位置、列名稱及位置、每個(gè)點(diǎn)之間的分隔。

設(shè)定輸入矩陣中用作畫(huà)圖的行列范圍。

③設(shè)置完成后,點(diǎn)擊“submit”提交畫(huà)圖任務(wù)。

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