同濟(jì)大學(xué)陳嘉瑜/高紹榮/江賜忠/高睿最新Dev Cell
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iNature
轉(zhuǎn)錄因子(TFs)在早期胚胎發(fā)育中發(fā)揮重要作用，但在這一過程中調(diào)節(jié)TF作用的因素、信號(hào)級(jí)聯(lián)的關(guān)系、全基因組定位以及對(duì)細(xì)胞命運(yùn)轉(zhuǎn)變的影響尚未明確闡明。
2024年4月3日，同濟(jì)大學(xué) 陳嘉瑜、 高紹榮、江賜忠及高睿共同通訊在 Developmental Cell 在線發(fā)表題為“ Defining a TFAP2C-centered transcription factor network during murine peri-implantation ”的研究論文， 該研究使用uliCUT&RUN-seq描述了一個(gè)以TFAP2C為中心的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，表明它涉及啟動(dòng)子-增強(qiáng)子相互作用，并調(diào)節(jié)TEAD4和KLF5功能來介導(dǎo)細(xì)胞極化。
值得注意的是，該研究發(fā)現(xiàn)母體維甲酸代謝通過誘導(dǎo)活性的SINEs去甲基化來調(diào)節(jié)TFAP2C的表達(dá)和功能，這表明RARG-TFAP2C-TEAD4/KLF5軸將母體到合子的轉(zhuǎn)變與極化聯(lián)系起來。此外，還發(fā)現(xiàn)基因組印跡和SNP轉(zhuǎn)移的遺傳信息都可以影響TF定位，從而以復(fù)雜的方式調(diào)節(jié)親本基因的表達(dá)。 綜上所述，該研究提出了一個(gè)以TFAP2C為核心元件，以代謝、表觀遺傳和遺傳信息為連接通路節(jié)點(diǎn)的TF調(diào)控小鼠胚胎發(fā)育的三元模型。
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