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ChemDraw 的使用方法（一）

時間：2020-06-07 來源：網(wǎng)絡(luò) 瀏覽：

ChemOffice作為有機(jī)化學(xué)常用的工具，包括在對于反應(yīng)的進(jìn)程、反應(yīng)機(jī)理、特定有機(jī)化合物的性質(zhì)（核磁氫譜、核磁碳譜、酸性、親水性等性質(zhì)）主要是由ChemDraw完成的。包括對于有機(jī)物空間結(jié)構(gòu)的建立、特定簡單力場下（分子動力學(xué)、光譜信息[紫外光譜、拉曼光譜]的模擬、核磁氫譜的模擬、最低能量態(tài)的鍵搜尋（單鍵、雙鍵）等）主要是由Chem3D完成。包括對于已知有機(jī)化合物的搜尋、已知反應(yīng)的檢索（特定檢索反應(yīng)物、生成物、催化劑、溶劑體系等）主要是由ChemFind完成。本篇文章主要講述ChemDraw的使用方法（以ChemDraw 18.0為例），同時以在文獻(xiàn)中經(jīng)常出現(xiàn)的工作為例進(jìn)行重復(fù)。[10篇文章]

圖 1.ChemDraw的工作頁面

具體菜單欄就不進(jìn)行一一介紹了，直接開始講應(yīng)用。

· 應(yīng)用一：反應(yīng)的書寫

事實(shí)上在每一篇涉及到有機(jī)合成的文章中，都會選擇使用ChemDraw。比如說最近出來的一篇關(guān)于“2，3-取代基喹啉在膦-酰胺配體催化劑非對映和不對稱選擇加氫”的文章中，對于反應(yīng)式的書寫如下：

圖 2.原文圖片（1）

可以看到，文章中的化學(xué)式有著極好的整潔和對稱，這就需要我們選擇調(diào)用view菜單下Show Crosshair（也可以直接選擇Ctrl+H），對于書寫工整有著極好的幫助：

圖 3.實(shí)際操作（1）

在這里有些同學(xué)會問吡啶基怎么加的？或者R1、R2、R3是怎么加的？事實(shí)上這些操作都很簡單，只需要找到功能欄的 “A” 符號（如圖 3所示），直接用輸入法輸入“雜原子（N、O、S等）、金屬原子等”即可，注：不可直接輸入取代基。

可能又有同學(xué)問了，在這里化學(xué)式占整個紙張的比重非常大，存在寫不開的尷尬境地。這里就需要完成兩個操作（任選其一就行）：

（1）修改化學(xué)式的大?。ㄈ鐖D 4選中化學(xué)式，右鍵scale對比例進(jìn)行設(shè)置，再次修改比例會在原先修改的基礎(chǔ)上累加）

（2）修改紙張大?。ㄟx擇File下Document Setting，對Document Size進(jìn)行修改，即可修改紙張大?。?/p>

圖 4.實(shí)際操作（2）

圖 5.修改分子式大小

完成了上述準(zhǔn)備階段，我們可以繼續(xù)書寫方程式了。

圖 5.實(shí)際操作（3）

在寫到反應(yīng)條件時，可以看到，我們輸入[Ir(COD)Cl]2時會出現(xiàn)錯誤提示，只需要把View下Show Chemical Warning取消掉即可（值得說一下，Show Chemical Warning針對反應(yīng)式正視圖錯誤、文本錯誤可以進(jìn)行突出顯示，提醒修改）。

另一方面，針對于數(shù)字下標(biāo)問題，只需要對所選數(shù)字右擊鼠標(biāo)，選擇Style下Subscript即可（快捷鍵F9），如果需要數(shù)字上標(biāo)，只需要在Style下Superscript即可（快捷鍵F10），如果什么都不用只需要在中間，選擇Formula（快捷鍵Ctrl+F）。

除了上述兩個問題，對于文本字號設(shè)置，也是對于美觀的一個重要體現(xiàn)，只需要選中文本，右鍵size下即可修改字號。