OriginPro:ROC曲線【數(shù)據(jù)繪圖】
OriginPro:ROC曲線【數(shù)據(jù)繪圖】
ScientificPlots
專注于數(shù)據(jù)繪圖和分析。Originlab,Excel,……
ROC曲線 的全稱是受試者工作特征(Receiver Operating Characteristic)曲線,是非常重要和常見的統(tǒng)計(jì)分析方法。
如果已經(jīng)計(jì)算好
FPR
和
TPR
,可以直接使用最簡(jiǎn)單的
Line
圖繪制。本教程使用的是原始數(shù)據(jù),需統(tǒng)計(jì)計(jì)算后給出對(duì)應(yīng)的參數(shù),并繪制
ROC曲線
。
數(shù)據(jù)格式
-
示例數(shù)據(jù)為使用兩種方法測(cè)量得到的RMSF患者和正常人的鈉水平,數(shù)據(jù)格式為
XYY形式,其中第1列為人群信息,第2列為Method1測(cè)量的結(jié)果,第3列為Method1測(cè)量的結(jié)果。
繪制圖形
-
選中后兩列數(shù)據(jù),使用
Statistics菜單中的ROC Curve來繪制圖形。 -
在彈出的對(duì)話框里設(shè)定參數(shù)。
-
Positive State Value:設(shè)定哪個(gè)State是正類,此處選擇 RMSF 。 -
Threshold Method:設(shè)定求解cutoffs的方法,可以使用默認(rèn)選項(xiàng)。 -
Test Direction:選擇檢測(cè)的數(shù)據(jù)方向,Positive v.s. High指大的測(cè)量值表示正類,Positive v.s. Low指的小的測(cè)量值表示正類。此例中選擇Positive v.s. Low,即鈉水平較小時(shí)為正類。 -
ROC Curve:勾選時(shí)會(huì)輸出 ROC曲線 。 -
Standard Error and Confidence Interval:勾選后輸出 曲線下面積 (AUC)的SE和可信區(qū)間。 -
With Diagonal Reference Line:勾選后顯示參考線,即(0,0)-(1,1)的連線。
-
Optimal Cutpoint:勾選后顯示最佳截?cái)帱c(diǎn)。
-
Recalculate:選中重計(jì)算方式,默認(rèn)的是Manual,即手動(dòng)更新。 -
Input Data:在Data里選定兩種方法的測(cè)量結(jié)果,即第2和3列;在State里選擇第1列數(shù)據(jù)。 -
Computational Control:在此處設(shè)定相關(guān)的計(jì)算參數(shù)。 -
Output:輸出數(shù)據(jù)的選項(xiàng),可以使用默認(rèn)值。 -
點(diǎn)擊
OK后得到結(jié)果,包括統(tǒng)計(jì)分析數(shù)據(jù)和圖,其中Area Under the Curve表示的就是曲線下面積。
格式設(shè)定
-
雙擊分析報(bào)告里的 ROC圖 ,在單獨(dú)窗口中打開圖形。
-
可以對(duì)最后的 ROC圖 進(jìn)行格式設(shè)定,包括曲線粗細(xì)、顏色、圖例等?!驹谖⑿殴娞?hào) 數(shù)據(jù)繪圖 (
ScientificPlots)后臺(tái)回復(fù) 格式 ,查看詳細(xì)教程】
完成圖形
所用軟件:OriginLab OriginPro 2022@Windows 11 pro 。
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