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OriginPro:ROC曲線【數(shù)據(jù)繪圖】

時(shí)間:2021-12-02 來源: 瀏覽:

OriginPro:ROC曲線【數(shù)據(jù)繪圖】

原創(chuàng) Changyu Wu 數(shù)據(jù)繪圖
數(shù)據(jù)繪圖

ScientificPlots

專注于數(shù)據(jù)繪圖和分析。Originlab,Excel,……

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#數(shù)據(jù)繪圖 74 個(gè)內(nèi)容
#OriginPro 73 個(gè)內(nèi)容

ROC曲線 的全稱是受試者工作特征(Receiver Operating Characteristic)曲線,是非常重要和常見的統(tǒng)計(jì)分析方法。

如果已經(jīng)計(jì)算好 FPRTPR ,可以直接使用最簡(jiǎn)單的 Line 圖繪制。本教程使用的是原始數(shù)據(jù),需統(tǒng)計(jì)計(jì)算后給出對(duì)應(yīng)的參數(shù),并繪制 ROC曲線 。

數(shù)據(jù)格式

  • 示例數(shù)據(jù)為使用兩種方法測(cè)量得到的RMSF患者和正常人的鈉水平,數(shù)據(jù)格式為 XYY 形式,其中第1列為人群信息,第2列為Method1測(cè)量的結(jié)果,第3列為Method1測(cè)量的結(jié)果。

繪制圖形

  • 選中后兩列數(shù)據(jù),使用 Statistics 菜單中的 ROC Curve 來繪制圖形。

  • 在彈出的對(duì)話框里設(shè)定參數(shù)。

    • Positive State Value :設(shè)定哪個(gè) State 是正類,此處選擇 RMSF 。

    • Threshold Method :設(shè)定求解 cutoffs 的方法,可以使用默認(rèn)選項(xiàng)。

    • Test Direction :選擇檢測(cè)的數(shù)據(jù)方向, Positive v.s. High 指大的測(cè)量值表示正類, Positive v.s. Low 指的小的測(cè)量值表示正類。此例中選擇 Positive v.s. Low ,即鈉水平較小時(shí)為正類。

    • ROC Curve :勾選時(shí)會(huì)輸出 ROC曲線

    • Standard Error and Confidence Interval :勾選后輸出 曲線下面積AUC )的SE和可信區(qū)間。

    • With Diagonal Reference Line

      勾選后顯示參考線,即(0,0)-(1,1)的連線。

    • Optimal Cutpoint

      勾選后顯示最佳截?cái)帱c(diǎn)。

    • Recalculate :選中重計(jì)算方式,默認(rèn)的是 Manual ,即手動(dòng)更新。

    • Input Data :在 Data 里選定兩種方法的測(cè)量結(jié)果,即第2和3列;在 State 里選擇第1列數(shù)據(jù)。

    • Computational Control :在此處設(shè)定相關(guān)的計(jì)算參數(shù)。

    • Output :輸出數(shù)據(jù)的選項(xiàng),可以使用默認(rèn)值。

  • 點(diǎn)擊 OK 后得到結(jié)果,包括統(tǒng)計(jì)分析數(shù)據(jù)和圖,其中 Area Under the Curve 表示的就是曲線下面積。

格式設(shè)定

  • 雙擊分析報(bào)告里的 ROC圖 ,在單獨(dú)窗口中打開圖形。

  • 可以對(duì)最后的 ROC圖 進(jìn)行格式設(shè)定,包括曲線粗細(xì)、顏色、圖例等?!驹谖⑿殴娞?hào) 數(shù)據(jù)繪圖 ( ScientificPlots )后臺(tái)回復(fù) 格式 ,查看詳細(xì)教程】

完成圖形

所用軟件:OriginLab OriginPro 2022@Windows 11 pro 。

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Changyu Wu

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